Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRBP28702 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRBP28702 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRBP28702 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRBP28702 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRBP28702 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRBP28702 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRBP28702 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRBP28702 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRBP28702 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRBP28702 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRBP28702 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRBP28702 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRBP28702 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRBP28702 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRBP28702 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RXRBP28702 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
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