Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms