Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms