Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP290O15078 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CEP290O15078 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CEP290O15078 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CEP290O15078 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CEP290O15078 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CEP290O15078 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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CEP290O15078 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CEP290O15078 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP290O15078 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CEP290O15078 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP290O15078 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP290O15078 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP290O15078 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP290O15078 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP290O15078 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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