Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm17727E9Q4V7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm17727E9Q4V7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17727E9Q4V7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17727E9Q4V7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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