Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms