Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms