Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CIPCQ9C0C6 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CIPCQ9C0C6 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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