Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCO2Q9BYV7 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BCO2Q9BYV7 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms