Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UHRF2Q96PU4 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms