Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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