Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CCDC96Q2M329 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC96Q2M329 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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