Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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