Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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