Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms