Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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