Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PRPF4BQ13523 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PRPF4BQ13523 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PRPF4BQ13523 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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