Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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