Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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