Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms