Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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PGGT1BP53609 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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PGGT1BP53609 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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