Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRGP23470 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
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