Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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