Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMLHEQ9NVH6 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms