Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HMGN3Q15651 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HMGN3Q15651 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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