Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms