Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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COL4A6Q14031 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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COL4A6Q14031 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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COL4A6Q14031 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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COL4A6Q14031 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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COL4A6Q14031 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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COL4A6Q14031 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL4A6Q14031 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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