Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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