Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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