Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NME3Q13232 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NME3Q13232 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NME3Q13232 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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