Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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CHAF1AQ13111 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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CHAF1AQ13111 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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CHAF1AQ13111 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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CHAF1AQ13111 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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