Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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