Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPN13Q12923 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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