Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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