Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXA3O43365 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXA3O43365 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXA3O43365 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXA3O43365 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXA3O43365 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXA3O43365 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXA3O43365 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXA3O43365 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXA3O43365 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXA3O43365 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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