Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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