Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SALL4Q9UJQ4 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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