Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNTN3Q9P232 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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