Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms