Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BBS9Q3SYG4 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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