Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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