Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SS18Q15532 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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SS18Q15532 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SS18Q15532 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SS18Q15532 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SS18Q15532 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SS18Q15532 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SS18Q15532 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SS18Q15532 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SS18Q15532 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SS18Q15532 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SS18Q15532 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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