Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
GAPVD1Q14C86 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GAPVD1Q14C86 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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