Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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