Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL1Q13616 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms