Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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TCOF1Q13428 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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TCOF1Q13428 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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TCOF1Q13428 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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