Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXO1Q12778 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms