Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
APOBRQ0VD83 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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