Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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