Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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